应用于蛋白质组学的数据非依赖型质谱采集方法及相关算法研究  

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作  者:张青[1,2] 李园园 李亦学 

机构地区:[1]上海交通大学,上海200240上海生物信息技术研究中心,上海201203

出  处:《中国科技期刊数据库 科研》2015年第12期261-262,共2页

摘  要:蛋白质组学研究中的数据非依赖型(Data;Independent;Acquisition;DIA)质谱采集方法;是指质谱在采集样品的二级质谱图时,按照设定的方法,采集所有母离子的碎片信息,而不是依赖与先前采集的数据进行母离子的挑选。与传统的数据依赖型(Data Dependent Acquisition,DDA)采集模式相比,DIA方法具有重复性好,蛋白质覆盖率高,定量准确性高等特点。基于这些特点,DIA方式正越来越多的受到重视。由于DIA方法采集到的数据,没有直接的母离子-子离子对应关系,因此,相较于DDA方法的数据处理流程,其数据处理流程更复杂,面临的问题也更多。基于此,对目前应用于DIA模式下的质谱数据采集方法和相应的数据处理算法进行了研究。

关 键 词:蛋白质组学 非依赖型质谱采集 

分 类 号:R346[医药卫生—基础医学]

 

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