SMC4、IGF2BP3和E2F3三基因组胃癌标志物的发现和临床验证  

作　　者：周晓颖[1] 葛军 华敏 赵冰 

机构地区：[1]南京医科大学第一附属医院消化科,江苏南京210029 [2]南京医科大学附属江苏盛泽医院消化科,江苏苏州215228

出　　处：《中文科技期刊数据库(引文版)医药卫生》2022年第5期025-034,共10页

基　　金：江苏省高等学校重点学科建设项目(JX10231801)和江苏省国家自然科学基金(BK20131021)。

摘　　要：本研究旨在通过生物信息学分析来鉴定胃癌(gastric cancer,GC)的诊断和预后标记基因。方法:建立生物信息学管道,从公共可用数据库GEO和TCGA中分析和选择不同的表达基因。检查和验证病例匹配的正常和肿瘤组织和血清样本。还检查了具有主要癌基因c-myc的候选基因之间的细胞增殖,侵袭和连接。结果:从公共可用数据库GEO和TCGA中检索到总共483个GC组织和105个正常组织。我们的算法选择了13个候选基因。我们样本中的验证表明,与45对组织中的正常组织相比,13个候选基因中有6个在GC组织中的表达水平显着升高。此外,SMC4、IGF2BP3和E2F3的高水平表达与晚期肿瘤分期或不良组织学类型相关。这三个基因的表达在血清样本中得到验证,并显示出GC和对照患者之间的显着差异。之后绘制ROC曲线,当我们将三个基因组合在一起时,敏感性和特异性达到最高水平(敏感性:83.3%,特异性:86.7%,AUC:0.9044)。我们还证明了SMC4、IGF2BP3和E2F3的RNA干扰都与增殖和侵袭有关,并被确定为c-myc的调节靶标。结论:我们确定了多种新的GC生物标志物,它们的组合显示出最高的诊断敏感性和特异性。

关 键 词：胃癌 生物标志物 RNA序列 微阵列 

分 类 号：R473[医药卫生—护理学]