基于生物信息学技术的Randall斑块免疫细胞浸润分析  

作　　者：彭齐鑫 黄群[1] 

机构地区：[1]右江民族医学院,广西百色533000

出　　处：《中文科技期刊数据库（全文版）医药卫生》2022年第12期242-245,共4页

摘　　要：通过分析Randall斑块的免疫细胞浸润情况,探索肾结石形成的免疫学机制。方法 从GEO数据库中下载GSE117518数据集,筛选出Randall斑块肾乳头与正常组织肾乳头的差异基因(DEGs),使用DAVID进行差异基因的基因本体论(Gene Ontology,GO)及京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析。将差异基因导入到STRING中构建蛋白-蛋白交互网络(Protein-Protein Interaction, PPI),并筛选出关键基因。使用CIBERSORTX对数据集进行免疫浸润情况分析。结果 本次分析中共筛选出82个差异基因,功能富集结果主要与钙离子结合,角质增生和视黄醇代谢有关。免疫浸润结果提示Randall斑块肾乳头中各型淋巴细胞比例较正常组织高,关键基因中GBP1、IFI44、IFI44L与免疫细胞相关性较高。

关 键 词：Randall斑块 泌尿系结石 生物信息学分析 免疫细胞浸润 

分 类 号：R543.5[医药卫生—心血管疾病]