肺动脉高压患者免疫相关标志物的筛选  

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作  者:岳巧玉 苏丹艳 庞玉生[1] 

机构地区:[1]广西医科大学第一附属医院儿科,广西南宁530021

出  处:《中文科技期刊数据库(全文版)医药卫生》2023年第5期38-41,共4页

基  金:广西医疗卫生重点学科建设项目,桂卫科教发〔2019〕19号;广西儿科疾病临床医学研究中心(编号:桂科AD22035219)。

摘  要:利用生物信息学探索肺动脉高压(Pulmonary arterial hypertension ,PAH)的免疫细胞浸润特征以及与之相关的标志物,有助于PAH的早期诊断和免疫治疗。方法 合并GSE113439和GSE117261数据集后,我们使用CIBERSORT算法探索PAH患者和健康肺组织之间22种免疫细胞的组成。使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)来探索关键模块和免疫细胞之间的相关性,对关键模块进行生物功能富集分析。通过支持向量机-递归特征消除法(support vector machine-recursive feature elimination ,SVM-RFE)、套索算法(least absolute shrinkage and selection operator ,LASSO)获得生物标志物。最后,通过 GSE48149数据验证生物标志物。结果 品红色模块与巨噬细胞M1正相关。综合筛选出SEPTIN6可作为PAH的潜在生物标志物。结论 SEPTIN6初步确定为PAH的潜在诊断标志物。

关 键 词:肺动脉高压 免疫浸润 生物标志物 SEPTIN6 

分 类 号:R543.2[医药卫生—心血管疾病]

 

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