结核分枝杆菌感染人原代巨噬细胞的生物信息学分析  

作　　者：于璐[1] 孙畅 王家路[1] 

机构地区：[1]新疆医科大学第一附属医院医学检验中心,新疆乌鲁木齐830054

出　　处：《中国科技期刊数据库 医药》2023年第12期42-45,共4页

摘　　要：应用生物信息学方法对结核分枝杆菌感染的人原代巨噬细胞转录组数据进行挖掘,为探究结核分枝杆菌感染机制和疾病诊断提供研究思路。方法 通过GEO数据库下载肺结核相关的转录组测序芯片数据GSE164287,分析获得差异表达基因,通过R语言对差异基因进行聚类分析、GO、KEGG分析及蛋白互作网络分析。结果 通过GSE164287转录组测序芯片差异分析显示377个差异基因,其中233个上调基因,下调基因143个;GO分析中生物学功能注释主要富集的词条是Lipopolysaccharide polysaccharide reaction ", "Response to molecules of bacterial origin", "Cytokine ? mediated signaling Pathway";KEGG分析鉴定出的41个生物学过程,主要富集的词条是Cytokine - cytokine Receptor interaction ", "IL?17 signaling pathway", "NF-kappa B signaling Pathway", "Pulmonary Tuberculosis"。多个信号通路通过CXCL8、TNF、CXCL12、CXCL1、IL-6等基因相互连接;构建PPI蛋白互作网络,TNF、IL6、IL1B、CCL3、CSF2聚集程度较高。结论 结核分枝杆菌感染人原代巨噬细胞在发挥机体免疫功能上可能与接多个信号通路或者聚集程度较高的重要分子具有相应的关联,其作用有待我们进一步的实验验证及功能研究。

关 键 词：肺结核 巨噬细胞 差异基因 生物信息学分析 

分 类 号：R52[医药卫生—内科学]