基于ALPPS大鼠模型术后时间序列肝脏转录组对Nsd2在肝脏再生中的初步研究  

作　　者：任洪冰 朱海[1] 金宗睿 周进原 文张[1] 

机构地区：[1]广西医科大学第一附属医院肝胆外科,广西南宁530021

出　　处：《中文科技期刊数据库（引文版）医药卫生》2024年第5期0188-0193,共6页

基　　金：国家自然科学基金委员会,地区基金(82160128)。

摘　　要：通过构建ALLPPS大鼠模型,并对术后四个不同时期的剩余肝脏体积(Future liver remnant,FLR)进行mRNA转录组测序分析,挖掘ALPPS术后影响FLR再生的关键基因,为研究肝脏再生提供理论基础和证据。方法 收集ALPPS术后12h、24h、48h和72h等四个不同时期的Wistar大鼠FLR进行转录组测序,通过STEM趋势分析挖掘不同时期差异表达基因,并对差异基因进行Reactome富集分析,挖掘再生相关通路,通过STRING数据库对富集在cell cycle通路的基因进行PPI网络分析筛选节点基因以及实验验证。结果 对四个时间FLR的转录组数据进行了趋势分析,识别出7个差异表达模块基因集,其中profile 18与肝脏再生速度同步变化,包含481个基因。对这些基因进行Reactome富集分析,得到237条显著通路(P<0.05)。在cell cycle通路中构建差异基因蛋白质互作网络,并发现Nsd2为关键节点基因,其mRNA表达在术后随时间显著上调,在48小时达到峰值并与FLR再生速率紧密相关。结论 profile 18中包括的481个基因可能在调控ALPPS术后FLR再生中具有重要作用,Nsd2节点基因可能通过调控细胞周期(Cell cycle)通路,从而促进ALPPS术后FLR的快速再生。

关 键 词：ALPPS 转录组测序 增殖 Nsd2 

分 类 号：R61[医药卫生—外科学]