基于缺氧相关基因预测宫颈癌预后模型风险模型的构建  

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作  者:李艳红 林雪芬 姜瑞娜  崔兆磊[3] 孙 阳 

机构地区:[1]福建中医药大学中西医结合学院,福建福州350122 [2]福建医科大学肿瘤临床医学院/福建省肿瘤医院妇科,福建福州350014 [3]福建医科大学肿瘤临床医学院/福建省肿瘤医院检验科,福建福州350014

出  处:《中文科技期刊数据库(全文版)医药卫生》2024年第11期146-150,共5页

摘  要:筛选缺氧相关基因,建立预测宫颈癌预后的风险模型,探索其与宫颈癌发生发展可能存在的关系。方法 获取癌症基因图谱(TCGA)数据库中,宫颈癌患者的转录组数据和临床病理资料,从 MSigDB数据库下载并通过生物信息学方法筛选缺氧相关基因,从而进一步建立宫颈癌预后预测模型。利用Kaplan-Meier 曲线、受试者操作特征性曲线(ROC)、C-index、校准曲线进行验证。基于R 语言探索风险模型与化疗药物敏感性的关系,分析风险模型与免疫功能之间的相关性,构建列线图模型。结果 构建了由TP53、P4HA2、EGLN1、PLOD2、CXCL8组成的缺氧相关的宫颈癌预后模型,在训练组与验证组都显示出较好的预测性能。宫颈癌缺氧相关风险模型与免疫细胞的浸润和对药物的敏感性表现出很强的相关性。结论 基于5个缺氧相关基因,构建的具有预后价值的宫颈癌风险模型可能是宫颈癌预后的预测工具,有望指导患者的个体化治疗。

关 键 词:宫颈癌 缺氧 预后模型 生物信息学 

分 类 号:R4[医药卫生—临床医学]

 

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