外泌体相关序列特异性DNA结合相关基因在肝细胞癌中的功能及差异表达分析  

作　　者：唐丽珠 李岳勇[1] 杨成亮 唐玉莲[3] 李根亮[4] 

机构地区：[1]右江民族医学院附属医院,广西百色533000 [2]右江民族医学院附属医院·广西生物医用材料研究重点(培育)实验室,广西百色533000 [3]右江民族医学院检验学院,广西百色533000 [4]右江民族医学院基础医学院,广西百色533000

出　　处：《中文科技期刊数据库（文摘版）医药卫生》2024年第12期246-254,共9页

摘　　要：探究外泌体相关序列特异性DNA结合相关基因在肝细胞癌中的功能及其表达差异的原因。方法 在建立肝细胞癌小鼠模型后,采用RNA测序技术对肿瘤组织和健康对照组织进行了基因差异表达分析。基于NCBI核酸数据库中的外泌体相关基因,筛选出在两个样本组织中差异表达的外泌体相关序列特异性DNA结合相关基因。GO和KEGG富集分析其在肝细胞癌中的可能作用,并AS和SNV / INDEL分析其差异表达的原因。结果 在两类样本中,共有大量差异表达的外泌体相关基因,其中序列特异性DNA结合相关基因69个,它们参与了10个生物学程序,包括4个细胞组分和20个分子功能,同时还涉及3条KEGG通路。这些功能包括调节转录因子的活性、转录因子与DNA的结合、特异性DNA序列的识别、核心启动子附近序列的特异性结合以及RNA聚合酶II启动子的转录调控。在调控RNA聚合酶II启动子转录和癌症转录失调过程中,起着至关重要的作用。在69个基因中,Myc和Klf4两个基因有AS事件,61个基因中发生了667个SNV/INDE事件,其中突变往往主要发生在外显子中。53个基因的SNV/INDE频率与其基因表达呈正相关。结论 大量外泌体相关基因在肝细胞癌中差异表达,且序列特异性DNA结合相关基因在肝细胞癌中可能转录因子活性,调控RNA聚合酶II启动子转录正调控等多种生物学过程。异常激活DNA转录,导致基因转录失调,从而促进肝细胞癌的发生和发展。AS和SNV/INDEL事件可能负责差异基因表达和转录调控。

关 键 词：外泌体 序列特异性DNA结合 肝细胞癌 差异表达 

分 类 号：R44[医药卫生—诊断学]