转录因子结合位点的计算预测方法研究进展  

Review on Computational Prediction of Transcription Factor Binding Sites

作　　者：杜耀华[1] 王正志[1] 

机构地区：[1]国防科技大学机电工程与自动化学院,中国湖南长沙410073

出　　处：《生命科学研究》2006年第S1期24-31,共8页Life Science Research

基　　金：国家自然科学基金资助项目(60471003)

摘　　要：转录因子结合位点的计算预测是研究基因转录调控的重要环节,但现有算法的预测特异性偏低.在深入分析转录因子结合位点生物特征的基础上,对当前基于保守模体和基于比较基因组学的两类计算预测方法进行了综述,指出了方法各自的优点和不足,并探讨了可能的改进方向.Computational prediction of transcription factor binding sites is an essential task in the research of transcription regulation,but the specificity of recognition results achieved by the current algorithms is quite low.According to the thorough analysis about biologic features of transcription factor binding sites,two classes of predicting methods,based on motif signals and comparative genomics,are reviewed respectively.For each method,besides the merits and defects,the possible directions for improvement a...

关 键 词：转录因子结合位点 计算预测 模体 比较基因组学 

分 类 号：Q75[生物学—分子生物学]