KEGG及其在顺式作用元件预测中的应用  

KEGG AND APPLICATION IN THE PREDICATION OF CIS-ACTING ELEMENT

作　　者：王子良[1] 许丽艳[2] 李恩民[1] 

机构地区：[1]汕头大学医学院生物化学与分子生物学教研室,汕头515031 [2]肿瘤病理研究室,汕头515031

出　　处：《生物信息学》2003年第1期29-32,共4页Chinese Journal of Bioinformatics

基　　金：国家自然科学基金(30170428和30370641);国家自然科学基金青年基金(39900069);广东省自然科学基金(37788);广东省自然科学基金(010431);广东省高校自然科学研究基金(200033);广东省医学科研基金(A2001419);汕头大学研究与发展基金(L0004)

摘　　要：随着生物信息学的飞速发展,与之相应的各种类型的数据库不断涌现,KEGG数据库便是其中之一。本文详细介绍了KEGG数据库的主要内容及其功能,并以运用该数据库Mat Inspector V2.2软件预测NGAL基因5’端转录调控区增强于元件为例说明了KEGG数据库在基因转录调控研究中的应用。With the fast development of bioinformatics,all kinds of relevant databases are keeping appearing, one of which is KEGG. This article will detailedly introduce the main content and functions of KEGG,and then illustrate its application in the study of gene transcriptional regulation by the example that Mat Inspector V2.2,a software in KEGG,is used to predict enhancer dements of 5' transcriptional regulation region of NGAL gene.

关 键 词：生物信息学 KEGG TRANSFAC软件 转录调控元件预测 

分 类 号：TP319[自动化与计算机技术—计算机软件与理论] Q75[自动化与计算机技术—计算机科学与技术]