基因表达谱信息分析软件IDEA与WebGEA  

IDEA AND WebGEA Softwares for Bioinformatics Analysis of Gene Expression Profiles

作　　者：王琦[1] 许杰[1] 郭政[1] 李霞[1] 

机构地区：[1]哈尔滨医科大学

出　　处：《生物信息学》2003年第1期33-36,共4页Chinese Journal of Bioinformatics

基　　金：国家自然科学基金(39970397;30170515);国家863计划(2002AA222052);国家863计划(2003AA2Z2051);黑龙江科技攻关重点(GB03C602-4);哈尔滨市科技攻关(2003AA3CS113);黑龙江自然科学基金(F0177);211工程"十五"建设项目

摘　　要：基因芯片具有高通量快速并行检测基因表达水平的功能,是功能基因组研究的有力工具。针对基因芯片常规的信息分析需要,我们初步设计开发了基因表达谱的信息学分析平台,包括基于单机的软件IDKA(Information Digger for Experiments of microArray)与网络应用程序WebGEA(WEB GeneChip Expression Analysis),分别支持用户运行独立程序与在因特网上提交数据运行服务器程序来完成数据采掘分析任务。该平台得到良好的应用,是解决基因芯片常规的信息分析问题的一个方便工具。Gene chip can test the gene expression level in a fast and high through put way and is a powerful technology for functional genome. To meet the need of general analysis of gene expression data, we developed two special platforms for the informatics analysis of gene expression profiles, one is IDEA (Information Digger for Experiments of microArray) based on personal computer,and the other is WebGEA(WEB GeneChip Expression Analysis)based on web,which aim at different analysis tasks for different kinds of users.The platforms have been proved to be useful in practical application.

关 键 词：基因表达谱 数据挖掘 基因芯 WEB平台 

分 类 号：Q617[生物学—生物物理学]