混合优化策略的蛋白质折叠结构预测  

Prediction of protein folding based on hybrid optimization strategy

作　　者：孙鹏飞 张健沛[1] 

机构地区：[1]哈尔滨工程大学计算机科学与技术学院,哈尔滨150001 [2]哈尔滨师范大学计算机学院,哈尔滨150080

出　　处：《哈尔滨工业大学学报》2009年第12期171-175,共5页Journal of Harbin Institute of Technology

基　　金：国家自然科学基金资助项目(60873037);黑龙江省教育厅科技资助项目(11511118)

摘　　要：为提高蛋白质折叠结构的预测精度,提出了一种融合改进模拟退火算法与序列二次规划法的预测策略.将序列二次规划法加入具有回火退火功能的模拟退火算法中,利用其局部最优化的能力对由模拟退火算法求得的全局优化结果进行二次优化,进而求得全局最优化结果.对所提方法进行了计算机仿真研究,并与其它方法进行了性能比较,实验结果表明,该方法能够有效提高蛋白质折叠结构的预测精度.In order to increase the prediction accuracy of protein folding,a prediction strategy of combining the improved simulated annealing algorithm and the sequential quadratic programming is brought forward.In this strategy,the sequential quadratic programming is introduced into the simulated annealing algorithm with tempering annealing function,and its local optimization capacity is used to optimize the optimal result gained by the simulated annealing algorithm once more,then the global optimization can be achi...

关 键 词：蛋白质折叠 模拟退火算法 序列二次规划法 优化 

分 类 号：T-55[一般工业技术]