秀丽线虫缺氧相关剪接调节因子的筛查  

Screening of the hypoxia-related splicing regulatory factors of C.elegans

作　　者：张继业[1,2] 任长虹[2] 庞剑会[1] 李稚锋[2] 刘虎岐[1] 张成岗[2] 

机构地区：[1]西北农林科技大学生命科学学院,陕西杨凌712100 [2]军事医学科学院放射与辐射医学研究所,蛋白质组学国家重点实验室,医学神经生物学国家重点实验室,北京100850

出　　处：《西北农林科技大学学报（自然科学版）》2010年第7期197-202,共6页Journal of Northwest A&F University(Natural Science Edition)

基　　金：国家"973"计划项目(2006CB504100);国家科技重大专项(2009ZX09103-616;2009ZX09301-002;2009ZX09503-002);国家自然科学基金项目(30900862;30771230;30600365);中国博士后科学基金项目(200801495;20060400051);医学神经生物学国家重点实验室开放基金项目(09-02)

摘　　要：【目的】基于RNA干涉文库,寻找与秀丽线虫缺氧损伤表型相关的剪接调节因子。【方法】利用喂饲RNA干涉(RNA interference,RNAi)文库筛选技术,对秀丽线虫基因组中的351个RNA结合蛋白(RNA bindingprotein,RBP)基因进行筛选。【结果】经过2次筛选共得到5个与缺氧相关的RBP编码基因,其中剪接因子1个,参与mRNA翻译过程的基因4个。【结论】剪接调节因子可能在mRNA的剪接和翻译水平上参与低氧应答。【Objective】The study was to find the splicing regulatory factors related to hypoxic injury phenotype.【Method】RNA-mediated interference(RNAi)library was used to target 351 RNA binding protein(RBP)-coding genes of C.elegans.【Result】RNAi knockdown of 5 hypoxia-related RBP genes was obtained,with a splicing factor and 4 genes involved in mRNA translation process.【Conclusion】Splicing regulatory factors may participate in the process of mRNA splicing and translation in hypoxic response.

关 键 词：喂饲RNAi文库筛选 秀丽线虫 缺氧 RNA结合蛋白 

分 类 号：Q75[生物学—分子生物学]