陕南水牛微卫星DNA遗传多样性研究  

Study ongenetic diversity of microsatellite DNA in Shaannan buffalo

作　　者：王斌[1,2] 昝林森[1,3] 杨彦杰[4] 钟昕[1] 黄磊[1] 王洪宝[1,3] 

机构地区：[1]西北农林科技大学动物科技学院,陕西杨凌712100 [2]汉中职业技术学院农林系,陕西汉中723000 [3]国家肉牛改良中心,陕西杨凌712100 [4]河南师范大学生命科学学院,河南新乡453007

出　　处：《西北农林科技大学学报（自然科学版）》2010年第8期1-7,14,共8页Journal of Northwest A&F University(Natural Science Edition)

基　　金：国家“十一五”科技支撑计划项目(2006BAD14B07);西北农林科技大学拔尖人才支持计划项目

摘　　要：【目的】分析4个陕南水牛群体的遗传多样性,为陕南水牛品种的资源保护和开发利用提供理论支持。【方法】利用10对微卫星引物,采用PCR扩增和非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,对192头陕南水牛(分别采自城固、南郑、宁强和汉滨4个群体,每群体48头)进行了遗传多样性检测,统计了各群体的等位基因频率、等位基因数、有效等位基因数(Ne)、遗传杂合度(H)、各群体间的奈氏标准遗传距离及多态信息含量(PIC),根据遗传距离进行了聚类分析。【结果】4个陕南水牛群体在10个微卫星位点共发现104个等位基因,其中有8个特有等位基因,等位基因频率为0.0052～0.3490,总群体各位点平均有效等位基因数为4.0174～13.1469;10个微卫星位点平均多态信息含量为0.7007～0.8932,均为高度多态;平均杂合度为0.7550～0.9288。聚类分析结果显示,城固群体与南郑群体首先聚在一起,然后依次同宁强、汉滨水牛群体聚在一起。【结论】10对微卫星标记可作为有效的遗传标记用于陕南水牛遗传多样性的分析;陕南水牛群体变异程度多样性丰富,选育程度较低;聚类分析结果符合陕南水牛的地理分布格局和产区的自然环境,4个群体之间遗传差异较小,遗传一致性程度较大。【Objective】The study was done to analyze genetic diversity of four landraces buffalo in southern Shaanxi and to provide support for the protection and utilization of resources of buffalo species in southern Shaanxi.【Method】192 Shaannan Buffalo(selected from Chenggu,Nanzheng,Ningqiang and Hanbin)were used to detect the genetic diversity,and allele frequency of each group,number of alleles,effective number of alleles(Ne),heterozygosity(H),Nei s standard genetic distance between groups and the polymorphic info...

关 键 词：陕南水牛 微卫星 遗传多样性 

分 类 号：S823[农业科学—畜牧学]