2007-2009年部分猪群PRRSV ORF5和Nsp2基因的克隆与序列分析  

Cloning and sequence analysis of ORF5 and Nsp2 genes of porcine reproductive and respiratory syndrome virus from some pig farms in 2007-2009

作　　者：邹敏[1,2] 吴发兴[3] 王福军[1] 李金积[1] 冯阳[1] 刘蕾[1] 李明义[1] 陈克正[2] 范根成[1] 李晓成[3] 

机构地区：[1]青岛易邦生物工程有限公司,山东青岛266032 [2]青岛科技大学材料科学与工程学院,山东青岛266061 [3]中国动物卫生与流行病学中心,山东青岛266032

出　　处：《西北农林科技大学学报（自然科学版）》2010年第10期7-14,共8页Journal of Northwest A&F University(Natural Science Edition)

基　　金：国家"十一五"科技支撑计划项目"重大动物疫病病原快速检测技术研究和开发"(2006BAD06A11)

摘　　要：【目的】了解2007-2009年部分猪群中猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)株的遗传演化规律。【方法】按常规方法,从2007-2009年收集的疑似蓝耳病猪群组织样品中分离PRRSV,应用RT-PCR方法,对分离的10株PRRSV的ORF5和Nsp2基因进行扩增,测序后与19个PRRSV参考毒株的ORF5、Nsp2基因进行核苷酸、氨基酸序列比较及遗传进化分析。【结果】分离到的SDWF5、SDCX1、LN3、LN8、LN12、SD2、SD5、SD14、ZB1、ZB2共10株PRRSV均属于美洲型PRRSV变异株,其ORF5基因全长均为603bp,编码约200个氨基酸,其推导氨基酸序列变异主要发生在9～39位;SDWF5、SDCX1、LN3、LN12、SD2、SD5、SD14、ZB2等8个分离株的Nsp2基因全长为2845bp,编码950个氨基酸,与代表毒株VR-2332相比,8个分离株在Nsp2基因推导氨基酸序列的480和532～560位发生了不连续的30个氨基酸缺失。与19个PRRSV参考毒株的ORF5、Nsp2序列进行比较后发现,10个分离株的ORF5、Nsp2基因核苷酸序列及其推导氨基酸序列均发生了较大变异。遗传进化分析发现,10个分离株与以CH-1a为代表的国内流行毒株处于同一分支,与JXA1等变异毒株的遗传距离较近。【结论】来源于不同猪群的10个PRRSV分离株的遗传关系存在交叉,没有明显的地域特征,但可能具有相同的始祖Ch-1a。【Objective】The study was to understand the genetic evolution of porcine reproductive and respiratory syndrome virus(PRRSV)strains from different pig farms in 2007-2009.【Method】10PRRSV isolates were isolated from 10pig farms suffered PRRS in 2007-2009,ORF5 and Nsp2 genes of these isolates were amplified,sequenced,compared and phylogenetic analysed with 19reference PRRSV.【Result】SDWF5,SDCX1,LN3,LN8,LN12,SD2,SD5,SD14,ZB1,ZB2 10are variant strains of North America PRRSV,of which ORF5 genes were composed of 603n...

关 键 词：猪繁殖与呼吸综合征病毒变异株 ORF5基因 NSP2基因 遗传变异 

分 类 号：S852.65[农业科学—基础兽医学]