甘蓝LFY基因的克隆及序列分析  被引量:3

Cloning and Sequence Analysis of LFYZQ from Brassica oleracea L. var. capitata L.

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作  者:汤青林[1] 王志敏[1] 任雪松[1] 宋明[1] 王小佳[1] 

机构地区:[1]西南大学园艺园林学院南方山地园艺学教育部重点实验室重庆市蔬菜学重点实验室,重庆400715

出  处:《中国蔬菜》2011年第4期17-22,共6页China Vegetables

基  金:国家自然科学基金(31000908);中央高校基本科研业务费专项资金(XDJK2009C124);重庆市自然科学基金(2009BB1307);西南大学博士基金(SWU110009)

摘  要:以甘蓝ZQ启动抽薹的茎尖为材料,分别提取DNA和RNA,以两对引物扩增并序列拼接得到甘蓝LFYZQ基因DNA序列和cDNA完整编码区,长度分别为2560、1239bp,与花椰菜、拟南芥、芥菜和萝卜同源性分别达到91%、87%、86%、87%。该基因含有3个外显子(452、394、393bp)和2个内含子(514、807bp),共编码412个氨基酸,内含子剪接位点均符合经典GT-AG法则。将LFYZQ与网上公布的12种十字花科植物LFY氨基酸序列按分子进化分成两类:甘蓝LFYZQ与花椰菜以及Jonopsidium属植物Jonopsidium acaule这3个分为一类;其余10种植物分为第二大类。LFYZQ蛋白分子量为46kD,是一个不稳定的疏水蛋白,存在N-十四(烷)酰化位点、蛋白激酶C磷酸化位点、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、酰胺化位点共4种活性位点。DNA and RNA were extracted from bolting stem apex of cabbage(Brassica oleracea L.var.capitata L.)cultivar ZQ and LFYZQ gene fragments were cloned by RT-PCR respectively with 2 pairs of primers.LFYZQ of DNA and cDNA sequence fragments assembly were respectively 2 560 bp and 1 239 bp.Analysis of the nucleotide sequence by BLAST on line indicated that homology of LFYZQ was up to 91 % between Brassica oleracea L.var.capitata L.and Brassica oleracea L.var.botrytis L.,up to 87 % between it and Arabidopsis thalian...

关 键 词:甘蓝 LFY 序列分析 

分 类 号:S635.1[农业科学—蔬菜学]

 

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