几种模式生物密码对的偏好模式分析  

Analysis of Modes of Codon-pair Biased Usage in Some Mode Species

作　　者：王芳平[1] 王志坚[1] 方玉田[1] 

机构地区：[1]天水师范学院物理与信息科学学院物理系,甘肃天水741001

出　　处：《中国医学物理学杂志》2011年第6期3059-3063,共5页Chinese Journal of Medical Physics

基　　金：天水师范学院中青年教师科研资助项目

摘　　要：目的:从进化的角度研究古菌、细菌和真核生物基因组中密码对的使用,得到密码对使用与生物进化的可能的规律。方法:生物统计学。结果:首先,比较了编码序列中密码对出现频数的观测值与理论值之差的分布,发现这种分布基本是随机的;其次,这个分布也表明密码对的使用普遍具有偏好性,且不同物种所偏好的密码对和偏好的程度是不同的;第三,终止密码对的使用也存在偏好性,对于同一个密码子与不同的终止密码组合时,其观察值与理论值的关系依赖于终止密码子的类型。结论:结果表明密码对的使用与基因组进化存在相关性。Objective: In order to obtain possible rule of codon-pair usage and genome evolution,from the point of view of evolution,to research codon pair usage in archaea,bacteria and eukaryote.Methods: Biostatistics.Results: Firstly,comparative analyses of distribution of the observed and statistically predicted codon pair frequency of occurrence,it is found that the distribution is random basically;secondly,the distribution indicat that most of the codon pairs' usage is bias,and the preference is different from different species;thirdly,most of the sense-stop codon pairs' usage is bias also,when the same sense codon is combined with different stop codon,sense-stop codon pair usage depends on the type of stop codon.Conclusions: The results indicate that the codon-pairs' usage associates with genome evolution.

关 键 词：密码对 终止密码子 基因组 

分 类 号：R312[医药卫生—基础医学]