适用于TGGE的微污染水体总DNA的提取方法比较  

COMPARISON OF DNA EXTRACTION METHODS FOR TGGE ANALYSIS IN MICRO-POLLUTED WATER

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作  者:叶姜瑜[1,2] 吕冰[1,2] 周积源 陈刚才[4] 

机构地区:[1]重庆大学城市建设与环境工程学院,重庆400045 [2]三峡库区生态环境教育部重点实验室,重庆400045 [3]广东星湖新材料有限公司,广东肇庆526071 [4]重庆市环境科学研究院,重庆400010

出  处:《环境工程》2013年第S1期269-272,共4页Environmental Engineering

基  金:重庆市重点攻关课题(cstc;2011ggB-20001);国家科技重大专项项目"三峡库区小江汉丰湖流域水环境综合防治与示范"(2013ZX07104004)

摘  要:对比蛋白酶K-CTAB法、SDS-酚氯仿抽提法和试剂盒法对微污染水体总DNA的提取效果,进一步通过PCR-TGGE电泳及优势条带切胶测序分析,结果表明:SDS-酚氯仿抽提法提取水体总DNA效果最佳,试剂盒法次之,经纯化后均能扩增成功,蛋白酶K-CTAB法失败;SDS-酚氯仿抽提法比试剂盒方法的TGGE图谱条带数更多,代表的生物多样性更全面;试剂盒方法对革兰氏阳性菌的DNA提取能力不及SDS-酚氯仿抽提法。It was made a comparison of proteinase K-CTAB method,SDS-phenol-chloroform extraction method and kit method in micro-polluted water's total DNA extraction,further by PCR-TGGE electrophoresis and advantages strip sequencing analysis. Results show that SDS-phenol-chloroform extraction method is best,kit method is better. They can successfully amplify after purification. Proteinase K-CTAB method failed. There are more TGGE band numbers and more comprehensive biodiversities in SDS-phenol-chloroform extraction method than the kit method. The kit method is less than the SDS-phenol-chloroform extraction method in the capacity of Gram-positive bacteria DNA extraction.

关 键 词:总DNA 微污染水体 PCR-TGGE 革兰氏阳性菌 

分 类 号:TU991.2[建筑科学—市政工程]

 

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