人类新基因ACBP5cDNA的克隆及其同源物在小鼠/鸡胚发育过程中的表达  

Cloning and Characterization of a Novel Human Gene ACBP5 cDNA

作　　者：王峦[1,2] 薛鹏[1] 程睿 付佳琪[1] 陈微[3] 慈宏亮[1,2] 李亦平[1,3] 

机构地区：[1]北京师范大学生命科学学院生物医学研究所 [2]浙江赛尔生物医学研究院,杭州310006 [3]美国哈佛大学牙医学院Forsyth研究所

出　　处：《中国生物化学与分子生物学报》2005年第2期164-170,共7页Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology

摘　　要：利用电子克隆的方法寻找具有重要结构域的人类新基因ACBP5 ,根据得到的序列信息用RT PCR的方法获得全长基因 .通过生物信息学方法预测其结构 ,采用整体原位杂交和组织RT PCR的实验方法 ,在小鼠和鸡胚胎实验模型中研究该基因在发育过程中的表达情况 ,并对其功能进行初步的预测 ,获得一个含有乙酰辅酶A结合蛋白 (acyl CoAbindingprotein ,ACBP)结构域的人类新基因ACBP5 .ACBP5基因的cDNA长度为 10 83bp ,生物信息学方法预测其定位在人第 1号染色体上 ,包含 7个外显子 ,6个内含子 ,包含一个 35 4bp的完整阅读框架 ,编码一个 118个氨基酸残基的蛋白 .在以小鼠胚胎和鸡胚为模型的整体原位杂交中 ,以ACBP5基因全长编码区为探针的结果均显示该基因在胚胎头部特异表达 ,并且主要集中在中脑与间脑之间的峡部 .成体小鼠的组织RT PCR的结果显示 ,ACBP5的同源基因在各组织中均有表达 .这提示ACBP5基因在不同物种中的表达可能比较保守 ,并与头部发育有密切关系 ,同时也对维持细胞的正常功能起到重要的作用 .Based on the bioinformatics, a novel human gene ACBP5 (acyl-CoA binding protein 5) cDNA was found and cloned into pCMV-sport6. The full length of ACBP5 cDNA is 1 083 bp and contains 7 exons and 6 introns. Its open reading frame(ORF) encodes a protein of 118 amino acid residues. The whole-mount in situ hybridization (WISH) of mouse and chicken embryo showed that the gene was specially expressed in the brain and mainly in the isthmus. The result of reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) of the mature mouse tissues showed that it was widely expressed in many organs. The result indicates that ACBP5 gene may have an essential role in the development of brain and the maintenance of the organs' normal functions.

关 键 词：ACBP5基因 生物信息学 乙酰辅酶A结合蛋白结构域 峡部 

分 类 号：Q74[生物学—分子生物学] Q78