基因表达数据聚类有效性分析的EFOM法  

EFOM Method for Validating Cluster of Gene Expression Data

作　　者：殷爱茹[1] 李栋[1] 黄亚楼[1] 

机构地区：[1]南开大学软件学院,天津300071

出　　处：《计算机工程与应用》2005年第17期53-55,71,共4页Computer Engineering and Applications

基　　金：天津市自然科学基金项目资助(编号:023600611);南开大学亚洲研究中心项目资助(编号:AS0405)

摘　　要：论文讨论了用于评估基因表达数据聚类有效性的FOM方法,并结合基因表达数据聚类本身的特点,对已有的FOM方法进行了分析,提出了扩展的FOM方法———EFOM方法。通过分析人工数据和基因表达数据的EFOM值与调整Rand索引值的关系,充分说明了EFOM方法更加适合评估基因表达数据聚类结果的有效性。This paper describes FOM method used to validate clustering,and analyses FOM method on the characteristics of clustering for gene expression data,and provides extended FOM method,EFOM method,By analyzing the relationship between values of EFOM and values of Adjusted Rand index,it concludes that extended FOM method-EFOM-is more suitable to validate clustering for gene expression data.

关 键 词：FOM EFOM Rand索引 基因表达分析 

分 类 号：TP301.6[自动化与计算机技术—计算机系统结构]