SEN病毒部分基因系统进化分析  被引量:1

Phylogenetic Analysis of Different Open Reading Frame of SEN Virus

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作  者:许东[1] 田德英[1] 黄元成[1] 张振纲[1] 陈红云[1] 皮斌[1] 宋佩辉[1] 

机构地区:[1]华中科技大学同济医学院附属同济医院感染科,湖北武汉430030

出  处:《中西医结合肝病杂志》2005年第4期212-213,217,共3页Chinese Journal of Integrated Traditional and Western Medicine on Liver Diseases

基  金:湖北省科委资助项目(No.2002AA301C32)

摘  要:目的:通过序列比对分析SEN病毒(SENV)不同开放阅读框(ORF)基因系统进化情况。方法:用聚合酶链反应(PCR)方法扩增武汉地区SENVORF1和ORF2基因,结合GenBank中SEN病毒基因信息对该基因进行序列测定、并采用clutal软件系统进行分析。结果:武汉SEN病毒株与北京株同源性较高,与日本株有一定的差异,和TT病毒有较大差异。结论:SENV可能不是TTV亲缘关系较远的变异株,而是一群不完全相同成员组成的病毒种。Objective: To phylogenetic analysis of different open reading frame (OFR) of SEN virus, Methods: Polymerase reaction products of SENV were sequenced and phylognetic analysis with clutal computer soft according to sequences on Genebank. Results: The homololgy of nuclcotide sequence between Wuhan isolates and Bejing isolate were semblable, had some difference between Japan isolate and much different with TT virus. Conclusion: SEN virus, belong to the Circoviridae family, may be different strain from TT virus.

关 键 词:SEN病毒 基因 系统进化 基因系统 进化分析 聚合酶链反应(PCR) ORF2基因 SENV 武汉地区 开放阅读框 

分 类 号:R373[医药卫生—病原生物学]

 

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