基因组序列中转录始点的预测方法研究  

A Research on Method of Predicting Transcription Start Site in Gengmic Seguence

作　　者：张慧[1] 陈恩红[1] 童庆[1] 

机构地区：[1]中国科学技术大学计算机系,合肥230027

出　　处：《计算机科学》2005年第12期151-154,共4页Computer Science

基　　金：国家自然科学基金资助(60005004);安徽省自然科学基金资助(01042302)

摘　　要：在生物信息学领域,基因组序列上转录始点预测是基因序列预测中重要而困难的问题。本文结合了基因序列中有重要生物意义的功能点的特征,设计了一个新算法,预测基因组序列中转录始点的位置。该算法利用权重矩阵以及判别分析方法,根据训练实例进行学习,获得判别函数用于预测。实验结果表明,本文方法具有较好的预测效果。Prediction of transcription start site in a genomic sequence is difficult but important in the field of gene prediction in bioinformatics. A novel algorithm is presented by integrating the features of some meaningful sites in a genomic sequence to predict the position of transcription start site. Discriminant functions are got by training with the method of discriminant analysis and weight matrix and then are used for prediction. It showes that the algorithm has attained a good＇overall result by an experiment.

关 键 词：转录始点 判别分析 权重矩阵 

分 类 号：TP393.08[自动化与计算机技术—计算机应用技术] Q987[自动化与计算机技术—计算机科学与技术]