基于BioJava的生物序列分析软件的设计  

Designing a BioJava-based Software for RNA Sequence Analysis

作　　者：唐四薪[1] 李义兵[2] 何红波[2] 

机构地区：[1]中南大学信息科学与工程学院,湖南长沙410083 [2]中南大学物理学院,湖南长沙410083

出　　处：《河南科技大学学报（自然科学版）》2005年第6期55-58,共4页Journal of Henan University of Science And Technology:Natural Science

基　　金：国家自然科学基金资助项目(60371046)

摘　　要：根据生物信息研究工作中对基因数据处理的实际需要,通过对生物大分子序列分析软件需具备的功能进行分析,并按照面向对象的方法,采用BioJava为开发工具,设计和开发了一个适用于生物序列分析的专用软件(SEQAnalysis),该软件具有独特的序列信息量计算及统计功能,并能将序列分布转化为XML格式,实现了生物信息分析的自动化。To meet the needs of research in biology,especially for the processing of bioinformational data, the authors designed and implemented a BioJava-based software for RNA sequence analysis, which is the result of analyzing user needs and adopting an object-oriented method.This software makes it possible to automatically process biological data and tremendously reduce the workload of researchers.

关 键 词：生物大分子序列 基因 生物信息 序列分析 

分 类 号：TP311.52[自动化与计算机技术—计算机软件与理论]