HIV流行毒株的DNA macroarray基因分型技术的研究  被引量:4

Determination of the epidemic HIV strain genotypes by DNA macroarray

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作  者:倪崖[1] 谭卓 房国坚[1] 金妙坚 李坤[1] 蒋娴 黄云坚 

机构地区:[1]浙江省医学科学院,杭州310013 [2]浙江澳亚生物工程研究院,杭州310018

出  处:《中国卫生检验杂志》2006年第1期12-14,共3页Chinese Journal of Health Laboratory Technology

基  金:浙江省医药卫生科学研究基金项目(2002B001);浙江省科研院所专项研究开发项目(2005F13024)

摘  要:目的:建立一种特异、相对简便的H IV流行毒株基因分型新技术。方法:从H IV-1抗体阳性标本中提取H IV前病毒DNA,使用H IV-1型共用引物进行PCR扩增。同时设计一条型特异性的探针,然后通过制作DNA m acroarray芯片,鉴别样本的H IV亚型。结果:DNA m acroarray分析可以检测我国H IV主要流行株基因型的特异性序列:B、C、CRF01-AE和CRF07-BC。结论:DNA m acroarray方法对H IV亚型进行分析是可行的,可以在H IV流行病学调查中应用。Objectlve:To establish a specific, relatively simple new technique in determining the epidemic HIV strain genotypes, nethods:Proviral DNA extracted from the HIV - 1 positive specimen was amplified by PCR with the shared primer of HIV - 1 type. The specific probe which could determinate the epidemic HIV strain in our country was designed in the primer. Then HIV subtypes were determined after making DNA macroarray. Results: The analysis could determinate the specific sequences of the epidemic HIV strain genotypes in our country: B, C, CRF01 - AE and CRF07 - BC. Conclusion: DNA macroarray was available for the determination of HIV subtypes completely and could be applied to the investigation of epidemiology.

关 键 词:人类免疫缺陷病毒 DNA MACROARRAY 基因分型 

分 类 号:R512.91[医药卫生—内科学]

 

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