日本血吸虫SJCWL06基因编码蛋白结构与功能的生物信息分析  

Analyzing the structures and function of SJCWL06 encoding protein of Schistosoma japonicum by bioinformatics

作　　者：曾少华[1] 汪世平[1] 张加祥[1] 吕志跃[1] 周松华[1] 刘雪琴[1] 徐绍锐[1] 姜孝新[1] 彭先楚[1] 李文凯[1] 

机构地区：[1]中南大学湘雅医学院病原生物学系血吸虫病研究室,长沙410078

出　　处：《国际医学寄生虫病杂志》2006年第1期10-14,共5页International JOurnal of Medical Parasitic Diseases

基　　金：国家"十五"重大科技专项课题(2002AA2Z3343);国家高技术研究发展计划(863计划)血防重大专项(2004AA2Z3530);教育部"985行动计划"(03-985-3);湖南省"十五"重点学科建设专项经费

摘　　要：目的分析和预测日本血吸虫SJCWL06基因编码蛋白的结构与功能。方法利用国际互联网中生物信息网站如美国国家生物技术信息中心(NCBI)等的相关信息,分析与预测该编码蛋白一、二、三级结构与功能。结果该基因长861bp,有一个完整的327bp的开放读框,编码109个氨基酸,其编码蛋白有一个信号肽,多个磷酸化位点和一个ABC-三磷酸腺苷酶的结构域,与蜜蜂(Apis mel-lifera)SMC3编码的mRNA基因序列同源性最高(84%)。结论SJCWL06基因编码蛋白具有进一步研究的潜在价值。Objective To analyse and predict tb.e structures and function of SJCWL06 encoding protein of Schistosoma japonicum. Methods The first, secondary and tertiary structures and function of SJCWL06 encoding protein were analyzed and predicted by using the prefer information of bioinforrnatics on interact, for example NCBI. Results The SJCWL06 gene is 861 bp in whole length, has an open reading frame （ORF） of 327 bp encoding 109 amino acids with a signal peptide, an ABC-ATPase domain, several phasphorylation sites and the highest similarity of SMC3 protein of Apis mellifera （84 % ）. Conclusion SJCWL06 encoding protein is potentially worth for the further studying.

关 键 词：日本血吸虫 生物信息学 基因 结构与功能 序列分析 

分 类 号：R969[医药卫生—药理学] R383.24[医药卫生—药学]