小波变换在蛋白质结构预测中的应用  

Prediction of Protein Structure by Wavelet Transform

作　　者：楼玉萍[1] 

机构地区：[1]浙江师范大学信息学院,浙江金华321004

出　　处：《科技通报》2006年第2期182-185,共4页Bulletin of Science and Technology

基　　金：浙江省自然科学基金资助项目(M303166)

摘　　要：蛋白质的结构决定蛋白质的生物功能,疏水性在蛋白质结构的形成过程中起到了关键性作用。本文在分析了α螺旋和β折叠的周期性基础上,将氨基酸序列映射为疏水值序列并对其进行小波分析然后再做傅立叶变换从而得到平均功率谱图(PSD)。结果表明采用连续小波变换能有效提取蛋白质二级结构的特征信息。Biology function relies on its protein structure. Hydrophobic plays a key role in the form of protein structure. By analyzing periodicity of α-helices and β-strands, sequences of aminophenol are transformed into sequences of hydrophobic values and process it by wavelet analysis and Fourier transform so that Power Spectrum Density （PSD） was gained. The result shows that continuous wavelet transform can pick up feature of 2-level protein structure availably.

关 键 词：小波变换 疏水性 Α螺旋 Β折叠 功率谱密度 

分 类 号：Q71[生物学—分子生物学]