一株野生鹧鸪源冠状病毒主要结构基因进化特性分析  

作　　者：张桂红[1] 付家栋[1] 任涛[1] 廖明[1] 曹伟胜[1] 罗开健[1] 辛朝安[1] 

机构地区：[1]华南农业大学兽医学院,广州510640

出　　处：《自然科学进展》2006年第4期433-438,共6页

基　　金：国家自然科学基金资助项目(批准号:39893290)

摘　　要：从野生禽类鹧鸪的喉气管拭子中分离到1株冠状病毒,命名为Partridge／GD／S14／2003 (简写为S14)．通过RT-PCR扩增、克隆测序获得了该毒株的全基因组序列(AY646283),序列经 DNAstar分析发现,S14毒株与肾型毒株JX1-99,TJ2-96 S1基因同源性最高,分别达到94．6％和93．4％,并且该毒株的s1基因还和QXIBV,LX4株也存在高度亲缘性,分别达到85％和 84．3％,同时对S14 S1基因BLAST时发现只有上述毒株和S14有高度同源．由此推测该鹧鸪分离株S14的进化可能与IBV肾型和腺胃型病毒存在一定关系．序列分析表明,S14毒株与Gen Bank中注册序列QXIBV,LX4的S2基因同源性最高分别达到97．2％和90．6％,都处于Ⅱ群．M 基因系统进化树研究发现,S14处于Ⅲ群,与SAIB20,GD6-98同源性最高,分别达到90．6％和 90．2％;而与其S1,S2基因同源较高的BJ,QXIBV株,M基因的进化关系却较远．N基因同源性和系统进化树分析发现,Ⅰ群毒株可能为H52和Gray株发生重组的结果,Ⅱ群毒株可能为 H120和D1466等毒株重组的结果,而S14株处于Ⅲ群,其N基因与QXIBV高度同源,达到 95．7％,Ⅳ群为肾型分离株．而与其M基因亲缘性最近的SAIB20,GD6-98则分处Ⅰ,Ⅳ进化群．

关 键 词：野生 鹧鸪 冠状病毒 结构基因 进化分析 

分 类 号：S865.95[农业科学—野生动物驯养] Q987[农业科学—畜牧兽医]