利用软件Array Designer 2.0设计7种病毒检测基因芯片探针  

作　　者：李志峰[1] 陈清[1] 俞守义[1] 

机构地区：[1]第一军医大学流行病学教研室,广州510515

出　　处：《解放军预防医学杂志》2006年第2期110-112,共3页Journal of Preventive Medicine of Chinese People's Liberation Army

基　　金：国家"八六三"基金课题项目(No.2003A02)

摘　　要：目的设计能同时检测人SARS冠状病毒、尼巴病毒、亨德拉病毒、狂犬病毒、登革病毒、乙脑病毒和西尼罗病毒的基因芯片探针,制备芯片用于对广州野生动物携带这7种病毒的流行病学筛查。方法利用生物学软件DNAStar对7种病毒所有序列进行比对,获得每种病毒有意义的特异序列,以此作为设计oligo探针的备选序列,利用生物软件Array Designer 2.0设计特异性好、长度均一、Tm值相近的探针。结果每种病毒设计优化选择出10条oligo探针,用来制备基因检测芯片。结论利用GenBank数据库和生物学软件Array Designer 2.0设计病毒基因芯片检测探针,是一种简便、快速、有效的方法。

关 键 词：基因芯片 oligo探针 ARRAY DESIGNER 2.0软件 

分 类 号：R115[医药卫生—公共卫生与预防医学] R445