生物序列局部比对的快速算法  

Fast Local Alignment Algorithm for Biosequence

作　　者：袁媛[1] 

机构地区：[1]嘉兴学院数学与信息科学学院,浙江嘉兴314001

出　　处：《嘉兴学院学报》2006年第3期66-68,共3页Journal of Jiaxing University

摘　　要：给出了一个可适用于大规模的、非同源的两两生物基因组序列局部比对的快速比对算法SLA,该算法在运算时间上优于已有的局部比对软件包:chaos．In this paper, we introduce the SLA （Super Local Alignment ）, the algorithm to create local alignment of divergent genomic DNA sequences. SLA is much faster while keeps the same or better performance, comparing with the existing tool： chaos.

关 键 词：序列的局部比对 算法 基因组 

分 类 号：O177.3[理学—数学]