北极太平洋扇区深海沉积物的细菌多样性研究  

Investigation on bacterial diversity of deep-sea sediments from Pacific Arctic

作　　者：苏玉环[1,2] 李会荣[2] 李筠[1] 俞勇[2] 陈波[2] 

机构地区：[1]中国海洋大学生命科学与技术学部,青岛266003 [2]中国极地研究中心国家海洋局极地科学重点实验室,上海200136

出　　处：《高技术通讯》2006年第7期752-756,共5页Chinese High Technology Letters

基　　金：973计划（2004CB719601）、中国极地研究中心极地科学青年创新基金（JD0200401）、科技部基础研究专项基金项目（2003DEB5J057）.致谢：此项工作是由国家财政部资助,国家海洋局极地考察办公室组织实施的“中国第二次北极考察项目（简称EHINARE-2003）”的一部分,参加此项工作的单住是中国极地研究中心、国家海洋局第一研究所、国家海洋局第二研究所等,在此一并表示感谢.

摘　　要：对北极太平洋扇区4个站位深海表层沉积物样品,采用PCR结合变性梯度凝胶电泳（PCR-DGGE）技术进行了细菌16S rRNA基因V3区序列的系统发育分析.结果表明,沉积物中的细菌多样性丰富,获得的40条序列归属于4个细菌类群：变形细菌（Proteobacteria,占全部序列的75%）、噬纤维菌-屈挠杆菌-拟杆菌群（Cytophaga-Flexibacter-Bacteroides,CFB,占10%）、放线细菌（Actinobacteria,占10%）和酸杆菌（Acidobacteria,占5%）.其中变形细菌（包括α、β、γ和δ-Proteobacteria）,而γ-Proteobacteria占全部序列的62.5%,是很明显的优势类群.在这些细菌类群中,β、γ-Proteobacteria在4个站位沉积物中均有分布.The bacterial diversity in the top layer of the four deep-sea sediment samples colleeted from different depth in the Pacific Arctic was investigated using PCR-DGGE （denaturing gradient gel eleetrophoresis） methods. Examination of 40 16S rDNA sequences obtained from DGGE bands shows that the bacterial phylogenetie composition of the sediments in the Pacific Arctic is diverse. Bacterial phylotypes fall into four lineages of the domain bacteria： α,β, γ and δ-Proteobacteria; Cytophaga-Flexibacter-Bacteroides （CFB） group; Actinobacteria ; Acidobacteria. 75% of sequences belong to the α,β,γand δ Proteobacteria. The subclass of the Proteobacteria, especially y-Proteobacteria predominates in this study.β,γ- Proteobacteria of these bacterial phylotypes are distributed in all four sediments.

关 键 词：北极太平洋扇区 深海沉积物 细菌 多样性 

分 类 号：Q503[生物学—生物化学] S432.42[农业科学—植物病理学]