nifA突变的苜蓿根瘤菌在根瘤中的转录组学分析  被引量:3

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作  者:田哲贤[1] 邹华松[2] 李健[1] 张远涛[1] 刘影[2] 俞冠翘[2] 朱家璧[2] Silvia Rüberg Anke Becker 王忆平[1] 

机构地区:[1]北京大学生命科学学院,蛋白质工程暨植物基因工程国家重点实验室 [2]中国科学院上海生命科学学院上海植物生理及生态研究所,植物分子遗传国家重点实验室 [3]Lehrstuhl für Genetik,Universitat Bielefeld,Postfach 100131,33501 Bielefeld,Germany

出  处:《科学通报》2006年第15期1787-1793,共7页Chinese Science Bulletin

基  金:国家重点基础研究发展计划(批准号:2001CB108901和2001CB108902);国家自然科学基金(批准号:30470940);德国Bundesministerium für Bildung und Forschung(批准号:031U213D);Deutsche Forschungsge-meinschaft(批准号:BIZ 7)资助项目.

摘  要:用全基因组微阵列比较了根瘤中苜蓿根瘤菌1021的nifA突变菌和野生菌的基因表达谱.分析结果表明,nifA的缺失引起601个基因的表达发生变化.这些基因分别属于生物大分子的合成代谢、三羧酸循环及呼吸代谢以及结瘤固氮过程等多个功能组,预示着根瘤中细菌的生长状态发生了显著的变化.在根瘤中,fixK以及受其激活的基因在nifA突变菌中的表达量显著高于野生菌.定量实时PCR分析表明,根瘤中fixLJ的转录水平在nifA突变菌中显著高于野生菌.通过统计学方法从13个表达发生显著变化的基因的上游调控序列中找到推测的NifA结合位点.

关 键 词:转录组 NIFA FixJ 根瘤细菌 

分 类 号:S154.3[农业科学—土壤学]

 

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