应用RAPD技术构建绞股蓝DNA指纹图谱  被引量:15

Construction of DNA fingerprint for Gynostemma Pentaphyllum (Thunb) Makino based on RAPD analysis

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作  者:庞敏[1] 邹芳平[1] 肖娅萍[1] 

机构地区:[1]陕西师范大学生命科学学院,陕西西安710062

出  处:《陕西师范大学学报(自然科学版)》2006年第3期87-91,共5页Journal of Shaanxi Normal University:Natural Science Edition

基  金:国家"十五"科技攻关项目(771148)

摘  要:以不同类型绞股蓝(Gynostemma Pentaphyllum,(Thunb)Makino)DNA为模板,进行RAPD反应条件的优化及RAPD结果分析.最终筛选的RAPD反应条件为:20μL PCR反应体系中包括了10×buffer2.0μL,Mg2+2.0 mmol/L,dNTP 0.2 mmol/L,引物0.5 mmol/L,Taq酶1U,模板DNA 50 ng.反应程序为94℃3 min→(94℃30 s→38℃40 s→72℃1 min)45个循环→72℃10min→4℃保持,并从66条随机引物中筛选出5条带型丰富、适合于绞股蓝分析的随机引物.以这5条随机引物对不同类型绞股蓝进行RAPD扩增,识别其特征性多态位点,建立分子标记检索表.The optimized RAPD analysis with different Gynostemma Pentaphyllum as templates in PCR amplitication was reported in this paper. The optional parameters for 20 μL PCR reaction system are 10 × buffer 2.0 μL, Mg^2+ 2 mmol/L, dNTP 0.2 mmol/L, random primer 0.5 mmol/L, Taq DNA polymerase 1U, and template DNA 50ng, respectively. The optimized protocol for the reaction is 94℃ ( 3 min) → 94℃ ( 30s ) → 38℃ ( 40s )→ 72℃ ( 1 min ) 45 cycles→ 72℃ ( 10 min ) → 4℃ ( constant temperature). The 5 primers were selected from 66 random ones to carry out this RAPD amplification so that the characteristic polymorphous sites of Gynostemma Pentaphyllum are located as well as the identification key based on molecular markers is established.

关 键 词:绞股蓝 RAPD DNA指纹图谱 

分 类 号:Q949.782[生物学—植物学]

 

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