花鲈(Lateolabrax japonicus)VAMP-2基因的特征研究  

作　　者：陈魁[1,2] 黄晓航[2] 包振民[1] Gaisano Herbert 

机构地区：[1]中国海洋大学海洋生命学院 [2]国家海洋局第一海洋研究所,青岛266061 [3]Department of Medicine and Physiology,University of Toronto,Toronto,M5S1A8,Canada

出　　处：《中国科学（C辑）》2006年第4期334-339,共6页Science in China(Series C)

基　　金：国家自然科学基金(批准号:40476060);国家863计划(批准号:2002AA629120)资助项目

摘　　要：应用反转录PCR和锚定PCR方法克隆了全长715个碱基的花鲈(Lateolabrax japonicus)SPV2基因,证明其编码110个氨基酸的VAMP-2蛋白.运用生物信息学研究工具进行的一级结构分析显示:SPV2蛋白含有SNARE基序及其核心精氨酸残基,其序列N端有一N-糖肽键的糖基化位点,C端有一跨膜结构域.高级结构预测揭示SPV2蛋白的主要空间构象是一个组成SNARE基序的α螺旋卷曲骨架,其主要细节都与X晶体衍射方法得到的大鼠VAMP-2结构相一致.半定量PCR结果表明:在mRNA水平上,VAMP-2基因在鱼体各组织中广泛表达,其中以脑组织最为突出,而肌肉组织则相对最少.

关 键 词：花鲈 VAMP-2蛋白 SNARE蛋白 生物信息学分析 

分 类 号：Q953[生物学—动物学]