一个基因序列及其注释数据库的管理系统  

Management system for database of sequences and annotation of genes

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作  者:焦岳宏[1] 陆海峰[1,2,3] 任振胜[1,2,3] 赖洪敏[1,2,3] 周洁[1,2,3] 张洁[2,3] 李有志[1,2,3] 

机构地区:[1]广西大学生命科学与技术学院,广西南宁530005 [2]广西大学微生物及植物遗传工程教育部重点实验室,广西南宁530005 [3]广西大学广西亚热带生物资源保护利用重点实验室,广西南宁530005

出  处:《广西农业生物科学》2006年第3期275-279,共5页Journal of Guangxi Agricultural and Biological Science

基  金:农业部948项目(2001-205);教育部重点项目(01094);广西科技攻关项目(桂科攻0228019-16);广西科学基金项目(桂科0135021)

摘  要:以微软公司的数据处理软件M icrosoft Exce l 2003为平台,利用其VBA语言,编写了能够从大量的基因及其注释结果中自动大规模地提取并处理关键信息项的宏程序系统——基因序列及其功能注释数据管理系统M DSA(m anagem en t system for database of sequences and functiona l annotation of genes)。由于具有多种文件输出格式,M DSA可与许多数据处理的操作系统兼容,如M icroG ridTA S(B ioR obotics L td,UK)微阵列制作仪中的基因信息上传软件系统。该管理系统是M icrosoft Exce l软件在专业数据库管理中二次开发的成功尝试,在前期的玉米EST和cDNA数据库管理工作中发挥了重要作用。Using Visual Basic for Applications (VBA) language in Microsoft Excel 2003, macroproeessor system, the management system for database of sequences and functional annotation of genes (MDSA) was established, which can massively and automatically withdraw and process key items of data from a large number of gene functional annotation. As MSDSFAG can export the files in various formats, it possesses better compatibility with different data management systems, such as a software system for uploading gene information in the microarrayer,MicroGridTAS (BioRobotics Ltd, UK ). This system is a successful attempt secondly to explore functions of Microsoft Excel software in managing special data, which play an important role in management of EST and eDNA database established previously by us in maize.

关 键 词:基因 数据 MDSA系统 

分 类 号:Q811.4[生物学—生物工程]

 

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