兔病毒性出血症病毒中国株(JX/CHA/97)全基因组分子克隆及序列分析  

Molecular cloning and sequence analysis of full-length genome of RHDV JX/CHA/97 strain

作　　者：倪征[1] 方维焕[2] 张玉颖[3] 云涛[3] 陈锦清[3] 刘光清[3] 

机构地区：[1]浙江大学 动物科学学院,浙江杭州310029 [2]浙江大学动物科学学院,浙江杭州310029 [3]浙江省农业科学院病毒学与生物技术研究所植物代谢基因工程试验基地,浙江杭州310021

出　　处：《中国预防兽医学报》2006年第6期668-671,675,共5页Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine

基　　金：浙江省自然科学基金资助(Y305047)

摘　　要：本研究首次完成了兔病毒性出血症病毒(Rabbit hemorrhagic disease virus,RHDV)中国分离株JX/CHA/97全基因组序列的测定与分析。研究结果表明,JX/CHA/97株的全基因组由7437个核苷酸组成,其基因组构成为：5′端有一个长度仅为9nt的非编码区,随后有2个阅读框架(ORFs),分别编码一个聚合蛋白和一个结构蛋白。在基因组的3′端也有一个非编码区,长度为59nt。另外,采用RACE方法获得了RHDV的poly (A)尾序,证明该结构至少含有27个A。根据RHDV衣壳蛋白的基因序列,将JX/CHA/97株与来自世界各地的22株RHDV分离株的基因组序列进行了比较与分析,并绘制了系统发生树。结果表明,RHDV各分离株之间存在较高的序列同源性,可以将它们至少分为6个拓朴群,提示RHDV有朝不同方向发生进化的趋势。The complete nucleotide sequence of the China strain of rabbit hemorrhagic disease virus （RHDV） was determined to be 7 437 nucleotides in length with a 5＇-terminal non-coding region of 9 nucleotides and a 3＇-terminal non-coding region of 59 nucleotides, Two open reading flames （ORFs） were found within this sequence coding for a polymerize protein and a structural protein. Besides, our data showed that the poly （A） tail of RHDV had 27 A at least. Sequence comparison studies revealed significant homology between nonstructural proteins or structural proteins of JX/CHA/97 strain and the other strains. However, the results also showed that groups of RHDV strains appeared to have evolved to different extents.

关 键 词：兔病毒性出血症病毒 JX/CHA/97株 克隆 序列分析 

分 类 号：Q785[生物学—分子生物学]