用于蛋白质结构预测的一种改进模拟退火算法的研究  

Research of a improvement of simulated annealing used in protein structure prediction

作　　者：刘云玲[1] 陶兰[2] 

机构地区：[1]中国农业大学信息与电气工程学院,北京100083 [2]深圳大学信息工程学院,深圳518060

出　　处：《生物信息学》2006年第4期173-175,共3页Chinese Journal of Bioinformatics

摘　　要：将一种模拟退火算法的改进方法作用遗传交叉算子的并行模拟退火算法PSA/GC,用于蛋白质结构预测的能量最小化问题,通过对三个蛋白质的实际测试,证实了PSA/GC比SA和PSA具有更强的寻优能力,能得到能量值更低的构象。通过对PSA/GC的交叉间隔和交叉手法进行了探讨,得到了有益的结论。Tiffs paper introduces to uses a improvement of Simulated Annealing Parallel Simulated Annealing with Genetic Crossover： PSA/ GC in energy minimization problem of protein structure prediction. Through experiments in three true proteins, PSA/GC is proved better than SA and PSA, it can achieve conformations which have lower energy values . Then the thesis investigates crossover interval and crossover method of PSA/GC , and obtains useful conclusions.

关 键 词：蛋白质结构预测 能量最小化 PSA/GC 交叉算子 交叉间隔 

分 类 号：Q51[生物学—生物化学]