番茄SRAP-PCR体系优化与品种分子鉴定  

Optimization of SRAP-PCR system and cultivar molecular identification in tomato(Lycopersicon esculentum L.)

作　　者：王燕[1] 龚义勤[1] 赵统敏[2] 刘广[1] 郁樊敏[3] 叶海龙[3] 柳李旺[1] 

机构地区：[1]南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室/园艺学院,江苏南京210095 [2]江苏省农业科学院蔬菜研究所,江苏南京210014 [3]上海市蔬菜科学技术推广站,上海201105

出　　处：《南京农业大学学报》2007年第1期23-29,共7页Journal of Nanjing Agricultural University

基　　金：上海市科技兴农重点攻关课题(沪农科攻字(2004)第9-1号);作物遗传与种质创新国家重点实验室开放课题(ZW2004012)

摘　　要：对番茄基因组DNA的SRAP-PCR体系中Mg^2＋、dNTPs和引物浓度进行了优化，结果表明反应体系中适宜浓度为Mg^2＋ 1．5—3．0mmol·L^-1，dNTPs0．05—0．20mmol·L^-1，引物0．25μmol·L^-1；模板DNA为10～20ng（10μL反应体系）。运用优化的体系，筛选获得3个合作906与其父母本多态性标记引物组合。利用15个引物组合对11个番茄主要品种以及1个近缘野生种进行种质鉴定的SRAP标记分析，10个多态性的引物组合共检测到55个多态性位点，平均每个引物可鉴别3．7个品种，双引物组合me8／em8-1与me6—1／em14-1可以区分所有供试材料。应用NTSYS-pc软件进行聚类分析（UPGMA），园艺性状相似的品种在较近的遗传距离聚类，表明SRAP可有效用于番茄品种资源鉴定与遗传多样性分析。The concentration of Mg^2＋ , dNTPs and primer in the SRAP-PCR system was optimized for genomic DNA in tomato. The optimized concentrations were Mg^2 ＋ at 1.5 3.0 mmol·L^-1, dNTPs at 0. 05 - 0. 20 mmol·L^-1, primer at 0. 25 μmol·L^-1, and DNA at 10-20 ng, with a total volume of 10 μL. Three polymorphic primer combinations for genetic purity testing of hybrid cuhivar Hezuo906 were obtained with the optimized system. The molecular identification of 11 tomato cultivars and one wild relative was conducted with the SRAP marker system. Ten out of 15 primer combinations used could detect 55 polymorphic loci. An average of 3.7 cultivars could be distinguished with each primer combination, and accessions used in the study could be distinguished with the combination of me8/em8 - 1 and me6 - 1/em14 - 1. Cluster analysis （UPGMA） showed the cultivars that share similar horticultural traits clustered at a lower genetic distance. The results indicated that SRAP would play an important role in tomato germplasm identification and genetic diversity analysis.

关 键 词：番茄 SRAP 体系优化 品种鉴定 

分 类 号：S641.2[农业科学—蔬菜学]