化学信息学开源软件的集成与复用  

Chemoinformatics and open source software integration and reuse

作　　者：乔园园[1] 吴夏[1] 杨玲[1] 张明涛[1] 

机构地区：[1]南开大学化学院中心实验室,天津300071

出　　处：《计算机与应用化学》2007年第1期133-136,共4页Computers and Applied Chemistry

摘　　要：软件集成与复用是提高开发效率和质量的重要途径,而开发标准是实现集成与复用的重要因素。通过分析InChI、Jmol和BALL等实例,提出了化学信息学开源软件开发的数据通信标准、界面标准和模块标准问题。在此基础上,以作者进行的分子相似性与差异性研究为例,展示了对开源科学计算软件SciLab的主成分分析(PCA)模块进行改进、集成和复用的情况,说明对开源软件应采取扬弃态度,保障集成、复用的成效。Software integration and reuse are important approaches to facilitate the development. Several main technologies are summarized and concepts of integration and reuse are clarified. The standardization of data communication, user interface and modulization are put forward for chemoinformatics with examples of InChI, Jmol and BALL. As an example, the improvement, integration and reuse of the PCA module of SciLab for molecule similarity and diversity study is illustrated for sublating the open spurce software resources.

关 键 词：开源 软件集成 软件复用 相似性 差异性 

分 类 号：O6-39[理学—化学] TP3-05[自动化与计算机技术—计算机科学与技术]