棉纤维次生壁加厚期cDNA-AFLP表达谱剖析和转录组图谱构建  

作　　者：潘玉欣[1] 马骏[1] 张桂寅[1] 韩改英[1] 王省芬[1] 马峙英[1] 

机构地区：[1]河北农业大学河北省作物种质资源重点实验室,保定071001

出　　处：《科学通报》2007年第12期1425-1429,共5页Chinese Science Bulletin

基　　金：国家重点基础研究发展计划(批准号:2004CB117302);国家自然科学基金(批准号:30671322);河北省自然科学基金重点项目(批准号:C2006001034)资助

摘　　要：棉纤维强度主要由棉纤维次生壁加厚期决定．以陆地棉品种中棉所8号和海岛棉品种Pima90-53建立的包含109个单株的种间杂交F2群体为材料，用cDNA-AFLP对棉纤维发育次生壁加厚期（20～25DPA）基因表达谱进行剖析，并构建了次生壁加厚期转录组图谱．37对AFLP引物组合共检测到138个多态性表达片段（transcript-derived fragments，TDFs），大小在100～722bp之间，其中75个TDFs（53．62％）在亲本和F2单株中均具有多态性．在75个TDFs中，37个和已发表的棉纤维EST同源性较高：9个和已克隆的棉纤维基因，如半胱氨酸蛋白激酶、液泡H^＋-焦磷酸激酶、液泡H^＋-ATP催化亚基、半乳糖蛋白、受体蛋白激酶、GIA／RGA-赤霉素应答元件和纤维素合成酶等的编码基因同源性高；其他TDFs可能代表棉纤维发育过程中的新基因片段．在75个TDFs中，有46个集中分布在一个连锁群上。

关 键 词：棉花 CDNA-AFLP 表达片段(TDFs)转录组图谱 纤维发育 

分 类 号：S562[农业科学—作物学]