跨膜蛋白结构预测新方法  

作　　者：刘宏德[1] 王睿[1] 卢小泉[1] 陈晶[1] 刘秀辉[1] 丁兰[2] 

机构地区：[1]西北师范大学化学化工学院,兰州730070 [2]西北师范大学生命科学学院,兰州730070

出　　处：《科学通报》2007年第23期2742-2745,共4页Chinese Science Bulletin

基　　金：国家自然科学基金(批准号:20775060;20335030);第4届教育部高校青年教师奖;甘肃省高分子重点实验室资助项目

摘　　要：基因组数据中大约有20%～30%的基因产物被预测为膜蛋白,膜蛋白是一类具有重要生物功能的蛋白质.预测膜蛋白跨膜区的数量和位置是生物信息学中重要的研究课题.提出了一种预测膜蛋白跨膜区的新方法——连续小波变换极大值谱(MSCWT).该法对8种SARS-CoV膜蛋白的预测准确度与常用膜蛋白预测软件TMpred相当,对MPtopo数据库中131种新的已知结构的螺旋束蛋白(共包含548个跨膜区)的预测显示,其跨膜螺旋区预测准确率为91.6%,膜蛋白序列的预测准确率为89.3%.

关 键 词：连续小波变换极大值谱(MSCWT) 膜蛋白 跨膜区 

分 类 号：Q51[生物学—生物化学]