抗HIF-1αmRNA锤头状核酶的计算机设计  

作　　者：岳军[1] 金玉[1] 

机构地区：[1]徐州医学院生物化学与分子生物学研究中心,附属医院检验科,江苏徐州221002

出　　处：《实验室科学》2007年第6期96-98,共3页Laboratory Science

摘　　要：设计一个抗缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)mRNA的锤头状核酶为构建它的基因表达载体选择靶点,以便用于肿瘤的基因治疗。从GenBank寻找缺氧诱导因子-1αmRNA的全序列,用RNA结构分析软件预测HIF-1αmRNA的二级结构并选择合适的核酶作用靶点,从而设计相应的锤头状核酶。HIF-1αmRNA的577位含有GUC三联体,可以作为核酶的切割靶点,设计的核酶包括22nt的催化活性中心和16nt的侧翼序列。计算机辅助预测证明此位点为合适的靶点,用Basic Local Alignment Search Tool(BLAST)筛选以确定的靶点序列的唯一性。成功设计抗HIF-1αmRNA锤头状核酶基因表达载体,为进一步运用核酶切割HIF-1αmRNA基因来抑制肿瘤生长铺平了道路。

关 键 词：锤头状核酶 缺氧诱导因子-1Α 基因治疗 

分 类 号：Q55[生物学—生物化学]