大熊猫γ-干扰素基因的克隆与序列分析  

Cloning and sequence analysis of IFN-γ gene in Ailuropoda melanoleuca

作　　者：黄道超[1] 张志和 杨光友[1] 张安居 郭万柱[2] 王成东 候蓉 沈富军 袁欣[2] 

机构地区：[1]成都大熊猫繁育研究基地濒危动物繁殖与保护遗传四川省重点实验室,四川成都610081 [2]四川农业大学动物疫病与人类健康四川省重点实验室,四川雅安625014

出　　处：《中国预防兽医学报》2008年第1期35-38,共4页Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine

基　　金：成都大熊猫繁育研究基金会资助项目

摘　　要：本实验应用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术,从ConA诱导培养的大熊猫外周血淋巴细胞总RNA中扩增得到大熊猫γ-干扰素基因(GenBank accession No:DQ630727),并将其克隆到pGEM-T载体中。经菌落PCR鉴定、序列测定与序列分析,结果表明,经克隆得到的IFN-γ基因开放阅读框由498个核苷酸组成,编码一个由166个氨基酸组成的多肽,包括编码19个氨基酸的信号肽和147个氨基酸的成熟肽,预测蛋白分子量和等电点分别约为20Ku和9.36。与GenBank中其他哺乳动物的IFN-γ基因比较,它与犬、猫、人、猪、牛、羊、马、兔、鼠等的核苷酸序列同源性在57.7%(鼠)～93.2%(犬)之间;IFN-γ编码氨基酸序列同源性在46.8%(鼠)～92.8%(犬)之间;进化树构建结果表明大熊猫与犬的遗传距离最近。The giant panda IFN-γ gene （GenBank accession No： DQ630727） was amplified by RT-PCR from total RNA of ConA-stimulated peripheral blood lymphocytes. The PCR product was cloned into pGEM-T vector and sequenced. The IFN-γ gene contained an open reading frame of 498 nucleotides encoding 166 amino acids, including the signal peptide of 19 amino acids. The estimated Mw （molecular weight） and pI were about 20 Ku and 9.36 respectively. The gene shared 57.7 %-93.2 % nucleotide homology and 46.8 %-92.8 % amino acid identity with those of other animals. Phylogenetic analysis based on the nucleotide sequence of the IFN-γ gene showed that giant panda had the closest genetic relationship with dog.

关 键 词：大熊猫 γ 干扰素 克隆 序列分析 

分 类 号：Q781[生物学—分子生物学]