登革病毒E蛋白区基因组特征和血清学分型相关性分析  

ANALYSIS OF CORRELATION BETWEEN THE CHARACTERISTICS OF GENOME AND SEROLOGICAL TYPING OF DENGUE VIRUS E PROTEIN

作　　者：张玲[1] 赵卫[1] 朱利[1] 龙北国[1] 贡树基[2] 叶惠媚[1] 陈创彬[1] 

机构地区：[1]南方医科大学公共卫生与热带医学学院病毒研究所,广州510515 [2]石家庄白求恩军医学院

出　　处：《现代预防医学》2008年第3期558-560,568,共4页Modern Preventive Medicine

基　　金：广东省自然科学基金(32833);广东省医学科学技术研究基金(A2006382);广州市科技攻关计划重点项目(2004Z2-E0214);国家自然科学基金(U0632009)

摘　　要：[目的]比较4种血清型登革病毒E蛋白型特异性抗原表位所在区域对应的基因序列差异,以期发现登革病毒的基因组特征和血清学分型之间的相关性,建立一种新的基因分型方法。[方法]利用DNAstar数据包中的Edit-seq将E蛋白中的型特异性抗原表位所对应的基因从登革病毒的全基因组中截取出来,再用ClustalX软件进行多序列比对,找出型内保守型间变异的基因,探索一种新的基因分型方法。[结果]E蛋白型特异性抗原表位276-281位氨基酸和E基因1387位碱基高度保守,型内完全相同,型间不同。[结论]E蛋白型特异性抗原表位276-281位氨基酸和E基因1387位碱基可以作为登革病毒分型的依据。[Objective] The corresponding gene sequences of specific antigen of 4 serotypes of Dengue virus E protein were compared, to find the correlation between the characteristics of genome and serological typing of Dengue virus. [Methocts] Cut off the corresponding gene sequences of E protein from the complete genome of Dengue virus, then multisequecing were carried out to find the gene which was conservative within the same serotype and variant in the other serntypes, and so as to explore a new method of gene typing. [Results] Specific antigen of E protein （276-281 amino acid） and E gene （ 1 387 nucleotide） were eonselwative within the same serotype and variant in other semtypes. [Conclusion] Specific antigen of E protein （276-281 anfino acid） and E gene （1387 nucleotide） are the bases of Dengue virus typing.

关 键 词：登革病毒 基因分型 血清学分型 

分 类 号：R373.33[医药卫生—病原生物学]