棉花EST-SSRs在香蕉中的通用性  被引量:18

Transferability of Cotton EST-SSRs Markers to Musa

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作  者:郑丽珊[1] 石玉真[2] 王静毅[1] 黄秉智[3] 冀小蕊[1] 张保才[2] 袁有禄[2] 武耀廷[4] 

机构地区:[1]中国热带农业科学院热带作物生物技术研究所,海口571101 [2]中国农业科学院棉花研究所农业部棉花遗传改良重点实验室,河南安阳455004 [3]广东省农科院果树研究所,广州510640 [4]海南大学农学院,热带园艺植物资源与遗传改良教育部重点实验室,海口570228

出  处:《中国农学通报》2008年第1期33-37,共5页Chinese Agricultural Science Bulletin

基  金:国家自然科学基金"SSR分子标记开发和在香蕉种质资源遗传分析中的应用"(No.30460070);海南省自然科学基金"香蕉栽培品种的SSR分子鉴定"(No.80431);科技部科技基础条件平台:"热带作物种质资源标准化整理整合及共享试点:香蕉种质资源DNA分子指纹图谱的构建"(2005DKA21000-5-001);农业部南亚热作专项"香蕉品种快速检测技术推广应用"(2007)资助

摘  要:香蕉SSR分子标记开发和应用有限,通过对棉花SSR分子标记在香蕉中的通用性研究。用1343对棉花EST-SSR引物对贡蕉(AA)和野蕉(BB)两个材料进行转移扩增,得到226对有效扩增的引物。进一步用该226对引物对20个香蕉品种和4个野蕉材料扩增,得到了157对多态性引物。157对多态性引物共扩增到1188个条带,平均7.6个;引物的多态信息含量范围在0.58~0.91之间。依据获得的SSR数据,应用非加权类平均聚类方法,在相似系数0.60水平上,将24个品种分为两大类群,类群I是以A基因组为主的品种群,类群Ⅱ是以B基因组和A基因组与B基因组杂交的品种群,证明了棉花EST-SSR分子标记在香蕉中具有通用性。In this report, 1343 EST-SSR Markers from cotton were screened for the transferability to Gongjiao (M. acuminata) and Yejiao (M. bilbisiana). There were 226 primer pairs with effective amplification, of which, 157 polymorphic primer pairs were found for characterization on the 24 biusa genotypes with vari- ous genome composition and distinct ploidy level. As a result, a total of 1188 alleles were obtained in 157 polymorphic primer pairs and averaged 7.6 alleles per locus. Polymorphism Information Content (PIC) ranged from 0.58 to 0.91. Based on the SSR data, the cluster analysis with unweight pair-group method using arithemetic averages produced two major clusters that closely corresponded with the genome composition of the varieties (A genome, and B genome and their hybrids between A genome and B genome). The results showed that SSR EST-Markers from cotton can be transferred to Musa.

关 键 词:棉花 香蕉 EST-SSP 标记 通用性 聚类分析 

分 类 号:S668[农业科学—果树学]

 

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