膜蛋白质间原子填充结构解析  

ANALYSIS OF PROTEIN CONTACT IN MEMBRANE PROTEIN

作　　者：孙鹏飞[1] 刘海龙[2] 陈天凯[3] 

机构地区：[1]哈尔滨工程大学 [2]哈尔滨师范大学 [3]黑龙江工商职业技术学院

出　　处：《哈尔滨师范大学自然科学学报》2008年第1期87-90,共4页Natural Science Journal of Harbin Normal University

基　　金：黑龙江省教育厅科学技术研究项目(11511118);哈尔滨师范大学科学技术研究项目(KM2006-06)

摘　　要：提出蛋白质间三对三原子填充结构定义,根据此定义对16个膜蛋白质间的原子填充结构进行解析,分析了原子填充结构的形成特点.并根据不同类型氨基酸形成填充结构的频率,分别构建了三对三原子填充结构及传统的一对一原子填充结构的可能性矩阵.In this paper, the definition of 3 to 3 contact in membrane protein was brought forward. We elicited prorein contacts from 16 membrane proteins on the basis of the definition, and discussed the characteristic of protein contact. The likelihood matrix for 3 to 3 contact and 1 to 1 contact was established according to the frequency of amino acids formed protein contact.

关 键 词：膜蛋白质 填充结构 可能性矩阵 

分 类 号：Q510.3[生物学—生物化学] TU528.202[建筑科学—建筑技术科学]