A型禽流感病毒的分子模式  

作　　者：寇铮[1,2] 雷富民[3] 王升跃[4] 周艳红[1] 李天宪[2] 

机构地区：[1]华中科技大学系统生物学系,湖北省生物信息与分子成像重点实验室,武汉430074 [2]中国科学院武汉病毒研究所,病毒学国家重点实验室,武汉430071 [3]中国科学院动物研究所,北京100080 [4]中国科学院国家人类基因组研究中心,上海201203

出　　处：《科学通报》2008年第9期1051-1056,共6页Chinese Science Bulletin

基　　金：国家科技基础性工作专项(批准号:2007FY210700);国家自然科学基金重大研究计划(批准号:90608020);国家重点基础研究发展计划(批准号:2005CB523007,2005CB523004);高等学校博士点专项科研基金(批准号:20050487037);中国科学院知识创新工程重要方向性项目(批准号:KSCX2-YW-N-065);欧盟第六框架项目(批准号:SP5B-CT-2006-044161,SP5B-CT-2006-044405)资助

摘　　要：A型禽流感病毒能跨越宿主屏障,引起人死亡.高致病性禽流感H5N1亚型病毒就是一个特例.跨宿主传播的分子机理目前仍不清楚.将不同亚型的237株流感病毒的内部蛋白序列转化为伪信号,采用小波包分解的方法提取能量特征.依据每株病毒的能量特征值,进行层次聚类.聚类结果显示,5种分子模式存在A型禽流感病毒中,并与跨宿主传播的表型相关联.分析结果同时显示,模式为C和E的病毒可以跨越宿主屏障,而模式为A,B和D的病毒缺乏此种能力.结果表明,可以用来构建一个早期预警系统,用来预测A型禽流感跨越宿主传播的可能性.

关 键 词：A型禽流感 H5N1 小波包分解 聚类 跨宿主传播 

分 类 号：S852.65[农业科学—基础兽医学]