苎麻COMT基因的克隆及序列分析  被引量:5

cDNA Cloning and Sequence Analysis of COMT Gene from Ramie

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作  者:黄春琼[1] 郭安平[1] 章霄云[1] 刘国道[2] 

机构地区:[1]中国热带农业科学院热带生物技术研究所,海南海口571101 [2]中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所,海南儋州571737

出  处:《中国农学通报》2008年第5期386-391,共6页Chinese Agricultural Science Bulletin

基  金:国家自然科学基金项目(30360057)

摘  要:利用RT-PCR法结合cDNA末端快速扩增(RACE)法从苎麻中克隆了与木质素合成相关的COMT基因的全长cDNA序列。所获得的COMT基因全长1318bp,包含一个开放阅读框1098bp,编码365个氨基酸。序列相似性检索结果表明,苎麻COMT全长cDNA与杨树COMT基因的序列同源性达82%,其编码的氨基酸序列与杏的COMT氨基酸序列同源性最高,达93%。同时还检索到该氨基酸序列包含一个O-甲基转移酶的保守结构。In this paper, the cDNA fragment encoding caffeic acid 3-O-methyltransterase (COMT) gene lrom Boehmeria nivea L. was cloned by RT-PCR and RACE technique .The size of the eDNA fragment is 1318bp, which includes an 1098bp open reading frame and encodes a peptide of 365 amino acids. The eDNA fragment in Boehmeria nivea L.shares 82% homology with the reported corresponding eDNA in Populus amygdalus at nucleotide level, 93% homology with Prunus dulcis at amino acid level.And the conserved domain of O-methyltransferase family was found in amino acids.

关 键 词:苎麻 基因克隆 CDNA末端快速扩增 咖啡酸-O-甲基转移酶 

分 类 号:S563.1[农业科学—作物学]

 

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