中国2005年～2006年鸡传染性支气管炎病毒地方分离株核蛋白基因的遗传变异分析  

Genetic variations of N protein gene of infectious bronchitis viruses strains isolated in China between 2005 and 2006

作　　者：马亚珍[1] 韩宗玺[1] 邵昱昊[1] 张庆霞[1] 刘胜旺[1] 孔宪刚[1] 

机构地区：[1]中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室禽传染病研究室

出　　处：《中国预防兽医学报》2008年第6期420-424,共5页Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine

基　　金：“十一五”国家科技支撑计划重大项目(No2006BAD06A03)

摘　　要：本研究应用RT-PCR方法扩增到我国2005年～2006年8个省市12株IBV病毒核蛋白基因,并将其进行了克隆、序列测定及分析。以疫苗株H120作为参考毒株,对12株IBV分离株核蛋白基因序列进行分析。结果发现我国分离株的N基因及其局部功能区序列存在广泛的氨基酸替代现象。同时还发现毒株CK/CH/LSD/05Ⅰ与疫苗株H120同源性最高(93.4%)。与GenBank中的11个IBV参考毒株核蛋白基因序列进行比较和分析,发现本研究分离的大部分毒株(9株)分布于第Ⅰ群中,可见我国主要的IBV分离株在N基因进化关系上形成了自己独立的进化群。通过与S1基因系统发育进化树比较发现,毒株CK/CH/LSD/05Ⅰ存在基因重组现象。以上结果表明我国2005年～2006年IBV毒株存在基因突变和基因重组现象。The N protein gene sequences of twelve IBV strains isolated in China between 2005 and 2006 were amplified by reverse transcriptase-polymerase chain reaction （RT-PCR）, sequenced and compared with that of H120 vaccine strains. Several amino acid substitutions were found in the N protein gene sequences. The CK/CH/LSD/05 Ⅰ strains had a closer relationship with Mass-type vaccines H120 （93.4 %）. Phylogenetic tree analysis showed that nine of the twelve isolates could be classified into the same cluster. Recombinations were also found in the genome of IBV isolate CK/CH/LSD/05 Ⅰ. These results suggested that gene mutations and recombinations had occurred in the Chinese IBV strains isolated between 2005 and 2006.

关 键 词：传染性支气管炎病毒 核蛋白基因 基因突变 基因重组 

分 类 号：S852.618[农业科学—基础兽医学]