应用ABEEM/MM方法研究尿素与缬氨酸二肽间的相互作用  

Interaction between Urea and Valine Dipeptide Based on ABEEM/MM Method

作　　者：赵丹[1] 宫利东[1] 邢永恒[1] 

机构地区：[1]辽宁师范大学化学化工学院,辽宁大连116029

出　　处：《北华大学学报（自然科学版）》2008年第3期213-216,共4页Journal of Beihua University（Natural Science）

基　　金：国家自然科学基金(20633050、20703022);辽宁省教育厅基金(20060494)资助课题

摘　　要：对尿素与二肽的相互作用的研究可为探讨尿素致蛋白质变性的机理提供基础．应用ABEEM／MM方法，对尿素和缬氨酸二肽间的相互作用进行了理论研究．结果表明，尿素对缬氨酸二肽的几何结构影响很大，使其骨架二面角发生了明显的扭转．此外，用该方法计算的电荷分布和键长、键角、二面角等结构参数，都与从头算的结果有很好的一致性．The interaction between urea and dipeptide can provide the basis for exploring the mechanism of urea denatures protein. The interaction between urea and valine dipeptide was computed on basis of ABEEM/MM method. Results showed that urea affected structures of valine dipeptide and twists evidently the backbone torsion angles of the dipeptide. In addition, the charge distributions and structural parameters such as bond lengths, bond angles and torsion angles calculated with ABEEM/MM method correlated well with those of ab initio method.

关 键 词：ABEEM/MM浮动电荷分子力场 尿素 缬氨酸二肽 电荷分布 

分 类 号：O641[理学—物理化学]