肉毒毒素E型重链的生物信息学分析  

Bioinformatic Analysis of Botulinum Neurotoxin Type E Heavy Chain(BoNT/E HC)

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作  者:赵国杰[1] 郝凤进[1] 关一夫[1] 

机构地区:[1]中国医科大学基础医学院生物化学与分子生物学系,辽宁沈阳110001

出  处:《贵阳医学院学报》2008年第3期243-247,共5页Journal of Guiyang Medical College

基  金:国家自然科学基金资助(30371401)

摘  要:目的:分析肉毒毒素E型重链(BoNT/E HC)的抗原表位及空间结构。方法:利用在线生物信息学分析工具以及其它分析软件分析重链蛋白的抗原表位和空间结构。结果:预测并显示了肉毒毒素E型重链的空间结构图,以及9个可能的重链的B细胞抗原表位,静电势图揭示了重链分子结构域的两性特点。结论:抗原表位的预测对于E型肉毒毒素相关诊疗试剂的开发有指导意义,而结构域的极性分析提示其等电点的不同可能在pH介导的穿膜中起了作用。Objective:To analyze botulinum neurotoxin type E heavy chain(BoNT/E HC) antigen epitopes and its spatial structure.Methods:Online bioinformatic analysis tools and some other analysis softwares were used.Results:Tertiary structure of BoNT/E HC chain was anticipated and demonstrated.Nine possible antigen epitopes of the HC were predicted,and electrical potential map revealed the amphoteric domains of the HC.Conclusions:The predicting of antigen epitopes is of importance to the exploiting of BONT/E related agents,and domain analysis suggests domain′s pI is important to pH mediated membrane-passing.

关 键 词:肉毒毒素类 抗原 表位 B淋巴细胞 氨基酸序列 基因重排 B淋巴细胞 重链 

分 类 号:Q936[生物学—微生物学]

 

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